生物信息學(xué)及系統(tǒng)生物學(xué)是一門研究生命系統(tǒng)中信息的內(nèi)涵、儲存、表達、傳遞、變異和進化的過程以及其中所蘊含的生物學(xué)意義的學(xué)科。它涉及到生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、計算機科學(xué)、數(shù)學(xué)和生物統(tǒng)計學(xué)等領(lǐng)域,是一門高度交叉的新興學(xué)科。近年來,隨著高通量技術(shù)的發(fā)展,生物學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)正以前所未有的速度積累。生物學(xué)的大數(shù)據(jù)時代已經(jīng)到來,這使生物信息學(xué)的應(yīng)用快速地延伸到傳統(tǒng)生物學(xué)研究的各個領(lǐng)域,從DNA、蛋白質(zhì)序列的分析、基因表達、表觀修飾、轉(zhuǎn)錄后、翻譯后修飾、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析、到基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)、代謝網(wǎng)絡(luò)、計算機輔助藥物設(shè)計乃至“精準醫(yī)學(xué)”的實現(xiàn),都有生物信息學(xué)的用武之地。
為此,我們重點實驗室成立了生物信息學(xué)及系統(tǒng)生物學(xué)平臺。平臺擁有先進的高性能計算集群,其中包括10個計算節(jié)點,1個八路胖節(jié)點,1個GPU加速節(jié)點,1個登錄節(jié)點,擁有總共13 Tflop/s的計算能力。全部高性能計算集群的不同節(jié)點通過56GB的計算網(wǎng)絡(luò)高速互聯(lián),使計算致源可以進一步整合優(yōu)化,為我們完成各種生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析提供了硬件條件。以此為基礎(chǔ),生物信息學(xué)及系統(tǒng)生物學(xué)平臺進一步建立完備的各類生物信息學(xué)分析軟件工具體系,致力于為重點實驗室的各課題組提供生物信息學(xué)的支持。同時,我們與澳大利亞蒙納士大學(xué)聯(lián)合建立了東南大學(xué)-蒙納士大學(xué)蘇州聯(lián)合研究院的生物信息學(xué)及系統(tǒng)生物學(xué)中心,聯(lián)合開展課題研究和聯(lián)合培養(yǎng)博士研究生。目前,我們的平臺正在不斷的發(fā)展壯大和自我完善,相信在未來生物信息系及系統(tǒng)生物學(xué)平臺將為重點實驗室的建設(shè)貢獻更多力量。